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돼지유행성설사병

[초록] 한국 돼지의 PED 바이러스 스파이크 유전자 분석 및 유병률: 2013-2022년

제주, 충남, 전북에서 주로 발생....2020년 이후 고병원성 비INDEL 유형(G2b) 우세

 

2013년 말부터 2022년까지 돼지유행성설사병(PED)은 1131건이 국가동물방역시스템(KAHIS)에 신고되었습니다. 겨울부터 봄까지 네 차례(2013~2014년, 2017~2018년, 2018~2019년, 2021~2022년)에 걸쳐 크게 발생했으며, 충남(CN), 전북(JB), 제주(JJ)에서 주로 발생했습니다.

 

1131건 가운데 140건의 PED 바이러스(PEDV)의 전체 스파이크(S) 유전자를 분석한 결과, 139건은 G2b 유전자형, 1건은 G2a 유전자형에 속하는 것으로 확인되었습니다. 이 중 2개 균주(K17GG1, K17GB3)는 미국에서 분리된 S INDEL(OH851 균주)과 유사했고, 12개 균주는 S 유전자 내 결실(뉴클레오티드(nt) 3-99) 또는 삽입(12 nt)이 있었습니다.

 

제주의 PED 바이러스는 지역적으로 독립적인 클러스터를 형성했습니다. 치환율(substitution rate; substitutions/site/year)은 충남에서는 1.5952×10-3, 전북에서는 1.8065×10-3, 제주에서는 1.5113×10-3 등으로 나타났습니다. Bayesian skyline plot 결과에 따르면 제주의 PED 유효 개체군 크기는 2013년부터 2022년까지 감소한 반면, 전남과 전북은 유지되었습니다.

 

본 연구의 140개 PEDV)와 GenBank의 200개 한국 참조 균주를 포함한 340개 한국 PEDV 균주의 유전형 분석 결과, 2020년 이후에는 고병원성 non-INDEL 유형(G2b)만이 우세한 것으로 나타났습니다. 따라서, 2020년 이후에는 G2b(non-INDEL) 유전자형에 의한 PED 발생이 유지될 것으로 예측됩니다.

 

[논문 원문(바로보기), Spike Gene Analysis and Prevalence of Porcine Epidemic Diarrhea Virus from Pigs in South Korea: 2013–2022, 박규남(농림축산검역본부 바이러질병과) 외, Viruses, 2023]

 

번역 및 편집 돼지와사람(pigpeople100@gmail.com)

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